【摘要】 本发明适用于基因工程领域，提供了一种片段连接支架的构建方法和系统，所述方法包括下述步骤：将测序得到的正反向信息映射到片段连接群上；根据映射到片段连接群上的多对正反向信息计算各片段连接群之间的平均长度，作为各片段连接群之间的空位大小；根据计算得到的片段连接群之间的空位大小和片段连接群之间的正反向关系构建scaffold，得到完整的scaffold图。本发明实施例由于根据多对正反向信息计算各片段连接群之间的平均长度，作为各片段连接群之间的空位大小，从而大大提高了scaffold构建中片段连接群之间的空位大小的估计精度，可适用于测序读长较短的基因组测序技术以完成测序片段的拼接任务。 【专利类型】发明授权 【申请人】深圳华大基因研究院 【申请人类型】科研单位 【申请人地址】518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼 【申请人地区】中国 【申请人城市】深圳市 【申请人区县】盐田区 【申请号】CN200810218342.5 【申请日】2008-12-12 【申请年份】2008 【公开公告号】CN101504697B 【公开公告日】2010-09-08 【公开公告年份】2010 【授权公告号】CN101504697B 【授权公告日】2010-09-08 【授权公告年份】2010.0 【IPC分类号】G06F19/00; C12Q1/68; G06F19/22; G16B30/20; G16B30/10 【发明人】朱红梅; 单杲; 倪培相; 阮珏; 王明伟; 李瑞强; 方晓东; 王俊; 杨焕明; 汪建 【主权项内容】一种片段连接支架构建方法，其特征在于，所述方法包括下述步骤：将测序得到的正反向信息映射到片段连接群上；根据映射到片段连接群上的多对正反向信息计算各片段连接群之间的空位大小平均长度，作为各片段连接群之间的空位大小；根据计算得到的片段连接群之间的空位大小和片段连接群之间的正反向关系构建片段连接支架，得到完整的片段连接支架图。 【当前权利人】深圳华大基因科技服务有限公司 【当前专利权人地址】广东省深圳市盐田区盐田街道洪安三街21号华大综合园7栋1010 【统一社会信用代码】124403006766757616 【家族引证次数】3.0 【家族被引证次数】23
